Signální dráha hedgehog se významně podílí na embryonální diferenciaci řady tkání, mutace nebo ovlivnění chemickými látkami jsou příčinou některých závažných vrozených vad. Hedgehog řídí rovněž aktivaci kmenových buněk řady tkání, nadměrná aktivace kmenových buněk může souviset se vznikem řady nádorů.
Jedna z bílkovin signální dráhy má označení smoothened (SMO), na ni jsou cíleny léky ze skupiny inhibitory hedgehog: glasdegib, sonidegib a vismodegib.
