Cirkadiální rytmus je biologický rytmus změn biologických funkcí, jako jsou krevní tlak, teplota nebo úroveň metabolismu. Jednotlivé tkáně mají víceméně nezávislé "biologické hodiny", "centrální hodiny" jsou v hypotalamu (část mozku). Hypotalamus řídí uvolňování melatoninu, který ovlivňuje činnost ostatních tkání a navozuje spánek. Hypotalamus je ovlivňován rovněž změnami zevního prostředí, zejména střídáním dne a noci (prostřednictvím světločivných buněk v očích).
Více v článku Spánek.
