Konference: 2008 IV. ročník DDPEO A I. ročník sympózia O cílené biologické léčbě
Kategorie: Nádorová biologie/imunologie/genetika a buněčná terapie
Téma: Prognostické a prediktivní faktory
Číslo abstraktu: 013
Autoři: Doc. MUDr. MVDr. Jozef Škarda, Ph.D. et Ph.D.; MUDr. Josef Srovnal, Ph.D.; Mgr. Lenka Radová, Ph.D.; doc. MUDr. Marián Hajdúch, Ph.D.; prof., MUDr. Jiří Klein, Ph.D., PETCS; prof. MUDr. Vítězslav Kolek, DrSc.; Ninette Amariglio; G. Rechavi
Deregulace epigenetických mechanizmů se
významnou měrou podílí na nádorové transformaci a progresi. RNA
editace adenozinu na inozin je místně specifická modifikace
helikálních struktur prekurzorové mediátorové RNA. Tento proces je
katalyzován takzvanými ADAR (adenosine deaminase acting on RNA)
enzymy.
Cílem práce byla detekce frekvence editovaných míst v kódovaných sekvencích transkriptů p53, BRCA1 (breast cancer 1, early onset), CYFIP2 (cytoplasmic FMR1 interacting protein 2), FLNA (filamin A) a BLCAP (bladder cancer associated protein) transkriptů. Uvedené editovací sekvence byly detekovány v normální plicní tkáni a ve zmražených vzorcích adenokarcinomu, spinocelulárního karcinomu, malobuněčného karcinomu, sarkomu intimy plicnice a plicních karcinoidů pomocí RT-PCR a statistické analýzy. Bylo zjištěno, že frekvence editace RNA je dvojnásobně vyšší v nenádorové plicní tkáni oproti plicním nádorům (9,13% a 4,43%, p=0,01). Dále byly zjištěny signifikantní rozdíly v editaci FLNA(p=0,0001) a BCLAP (p=0,0125) transkriptů mezi adenokarcinomy a velkobuněčnými karcinomy plic. Prognostický význam změn frekvence editace RNA v daných sekvencích bude předmětem dalších studií.
Práce byla podpořena grantem MSM 6198959216.
Cílem práce byla detekce frekvence editovaných míst v kódovaných sekvencích transkriptů p53, BRCA1 (breast cancer 1, early onset), CYFIP2 (cytoplasmic FMR1 interacting protein 2), FLNA (filamin A) a BLCAP (bladder cancer associated protein) transkriptů. Uvedené editovací sekvence byly detekovány v normální plicní tkáni a ve zmražených vzorcích adenokarcinomu, spinocelulárního karcinomu, malobuněčného karcinomu, sarkomu intimy plicnice a plicních karcinoidů pomocí RT-PCR a statistické analýzy. Bylo zjištěno, že frekvence editace RNA je dvojnásobně vyšší v nenádorové plicní tkáni oproti plicním nádorům (9,13% a 4,43%, p=0,01). Dále byly zjištěny signifikantní rozdíly v editaci FLNA(p=0,0001) a BCLAP (p=0,0125) transkriptů mezi adenokarcinomy a velkobuněčnými karcinomy plic. Prognostický význam změn frekvence editace RNA v daných sekvencích bude předmětem dalších studií.
Práce byla podpořena grantem MSM 6198959216.
Datum přednesení příspěvku: 27. 11. 2008
